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瓊脂糖偶聯(lián)甘露糖的凝膠的制備

2025-11-12 [21]

瓊脂糖偶聯(lián)甘露糖的凝膠制備主要涉及瓊脂糖與甘露糖的混合及凝膠化過程,以下是詳細的制備步驟及注意事項:

一、材料準備

  • 瓊脂糖:選擇合適的瓊脂糖濃度,根據(jù)目標分子大小調(diào)整。例如,分離1kb以下DNA推薦使用1.5%濃度,大片段(>5kb)則用0.5%濃度。

  • 甘露糖:作為配體,與瓊脂糖混合以改善凝膠性能。

  • 緩沖液:常用TAE(Tris-Acetate-EDTA)或TBE(Tris-Borate-EDTA),需與制膠緩沖液一致。

  • 其他材料:制膠模具(含梳子)、電泳槽、染料(如溴化乙錠EB或更安全的RedView/GelGreen)等。

二、制備過程

  1. 緩沖液配制

    • 根據(jù)需要配制適當濃度的緩沖液,如將5×TBE緩沖液稀釋至0.5×TBE。

  2. 膠液制備

    • 稱取適量瓊脂糖,置于錐形瓶中。

    • 加入配制好的緩沖液,放入微波爐或電爐上加熱至瓊脂糖全部熔化。加熱過程中要不時搖動,使附于瓶壁上的瓊脂糖顆粒進入溶液。加熱時應蓋上封口膜,以減少水份蒸發(fā)。

  3. 膠板制備

    • 將有機玻璃膠槽兩端分別用橡皮膏緊密封住,置于水平支持物上。

    • 插上樣品梳子,注意梳子齒下緣應與膠槽底面保持1mm左右的間隙。

    • 向冷卻至50-60℃的瓊脂糖膠液中加入染料(如EB),使其終濃度為0.5μg/ml(也可電泳后再染色)。

    • 用移液器吸取少量融化的瓊脂糖凝膠封橡皮膏內(nèi)側(cè),待瓊脂糖溶液凝固后將剩余的瓊脂糖小心地倒入膠槽內(nèi),使膠液形成均勻的膠層。倒膠時的溫度不可太低,否則凝固不均勻;速度也不可太快,否則容易出現(xiàn)氣泡。

  4. 凝膠凝固

    • 待膠凝固后撥出梳子,注意不要損傷梳底部的凝膠。

    • 向槽內(nèi)加入緩沖液至液面恰好沒過膠板上表面。

  5. 甘露糖偶聯(lián)(此步驟可能因具體實驗需求而異,以下是一種可能的偶聯(lián)方式):

    • 在凝膠制備過程中或制備后,通過化學方法將甘露糖偶聯(lián)到瓊脂糖凝膠上。這通常涉及使用偶聯(lián)劑(如碳二亞胺)將甘露糖的羧基與瓊脂糖的氨基或羥基連接起來。

    • 偶聯(lián)條件(如溫度、pH值、反應時間)需根據(jù)具體實驗需求進行優(yōu)化。

三、注意事項

  • 溫度控制:瓊脂糖溶液溫度過高(>65℃)會導致孔徑不均,過低則凝固緩慢。倒膠前建議膠液冷卻至50-60℃。

  • 氣泡排除:倒膠前用移液槍吸出氣泡,或加入少量異丙醇輔助消泡。灌膠后盡量排除梳孔之間或底部的氣泡。

  • 凝膠厚度:凝膠厚度建議3-5mm,以獲得良好的分離效果。

  • 染料選擇:EB具有致癌性,操作時需戴手套、護目鏡,染色后避免長時間暴露??蛇x擇無毒害性的核酸染料(如RedView)。

  • 儲存條件:未用完的凝膠可浸泡于電泳緩沖液中,4℃保存不超過2周。

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